El Juzgado de Garantía de Cauquenes sobreseyó de forma definitiva la querella presentada en 2021 por la Municipalidad de Cauquenes contra el ex alcalde Juan Carlos Muñoz, debido a su fallecimiento. Esta decisión se fundamenta en el artículo 250 letra d) del Código Procesal Penal, que extingue la responsabilidad penal por muerte del acusado.
Sin embargo, la Fiscalía de Cauquenes ya había solicitado en dos ocasiones el cierre del caso por falta de pruebas suficientes contra Muñoz mientras aún vivía. En un documento del 7 de mayo de 2024, la Fiscalía indicó que "de conformidad con el artículo 248 letra C del Código Procesal Penal, esta fiscalía ha decidido cerrar la investigación y no perseverar en este procedimiento, por cuanto durante la investigación realizada no se han reunido antecedentes suficientes para fundar una acusación en contra del imputado".
Adicionalmente, una auditoría externa contratada por la Municipalidad de Cauquenes, que costó más de 14 millones de pesos, no encontró evidencia de delitos en la administración del fallecido alcalde. Solo se detectaron algunas faltas administrativas cometidas por funcionarios con años de servicio.
En una entrevista con radio Red Géminis, Juan Andrés Muñoz, actual CORE de la Provincia de Cauquenes e hijo del ex alcalde, afirmó que su familia y su equipo jurídico, liderado por el abogado Isidro Solís, están evaluando presentar una demanda contra la actual alcaldesa Nery Rodríguez y otros responsables de la querella. Muñoz sostuvo que las acusaciones eran falsas y que la demanda solo causó daño a su familia.
